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微生物肥料是指一類含有活的微生物并在使用中能獲得特定肥料效應能增加植物產量或提高品質的生物制劑。
微生物肥料的分類
我國微生物肥料種類繁多，截至目前還沒有一套完整統一的分類系統，根據分類的標準不同，有如下幾種分類方法：
按作用機類
1、狹義的微生物肥料：指通過微生物的生命活動增加植物營養元素的活性和供應量，進而增加產量，即含有肥料特性的微生物制劑，這類產品雖不具有養分，但卻有肥料的功能。
2、廣義的微生物肥料：該種微生物肥料略有或沒有養分供應功能，但卻有其他功效，如刺激植物生長或拮抗某些病原微生物的致病作用，降解有害污染物等，這類微生物肥料更應該稱為“微生物制劑”而不是肥料，但現都統稱為微生物肥料，在農業部統一登記備案。
按微生物種類劃分
細菌肥料：如固氮細菌肥料、溶磷細菌肥料、解鉀細菌肥料。
真菌肥料：該類肥料包括外生菌根菌劑和內生菌根菌劑兩種類型，如叢枝菌根、菌根菌劑、蘭科菌根菌劑。
放線菌肥料：如抗生素菌肥；
藻類肥料：如固氮藍藻等。
按功能不同分類
根據功能不同又可分為：
溶磷微生物肥料、解鉀微生物肥料、有機質分解微生物肥料等，如豆科植物接種劑和土壤磷素活化劑等。同一類功能的微生物肥料也可以是不同微生物種類的肥料，如溶磷菌肥，既可以是細菌肥料也可以是真菌肥料，因為同一微生物具有不同功能、或不同微生物具有相同功能的現象在微生物肥料界非常普遍。
按含有微生物種類的多少劃分
分為單一微生物或復合微生物肥料等。
單一微生物肥料：只含有一種微生物作用的肥料。
復合微生物肥料：即多種微生物通過一定比例混合在一起所形成的微生物制劑。
微生物+有機肥=生物有機肥
微生物+化肥=生物復混肥
微生物+有機肥+化肥=生物有機無機復合（復混）肥
農業部登記的微生物肥料種類
目前農業部登記的微生物肥料產品共有：
9個菌劑類品種：根瘤菌劑、固氮菌劑、溶磷菌劑、硅酸鹽菌劑、菌根菌劑、光合菌劑、有機物料腐熟劑、復合菌劑和土壤修復菌劑。
2個菌肥類品種：復合生物肥料和生物有機肥料。在劑型上分為液體和固體，固體又分為粉末和顆粒等。
效果 VS 問題
微生物肥料應用效果
1、增加作物產量：
各類微生物肥料的增產幅度在10% 左右，其中以復合微生物肥料增產效果明顯，達到20% 以上。研究表明：單獨施用微生物肥料沒有配施有機肥或化肥對馬鈴薯的增產效果明顯，但是微生物肥料在作物增產中只起到輔助作用，不能代替有機肥和化肥而單獨使用。
2、改善作物品質
微生物肥料能改善作物品質已是不爭的事實。
某些微生物肥料即使沒有明顯的增產作用，但仍然能改善作物品質。
施用微生物肥料能夠在明顯提高蔬菜含糖量和維生素C含量的同時降低蔬菜的硝酸鹽含量。
微生物肥料對水果品質的影響也比較明顯。劉利軍等人的研究表明：在使用微生物肥料后，碭山酥梨葉片氮含量顯著降低，微量元素含量、糖酸比、含糖量和Vc 含量等明顯增加，并證明了果實的品質、耐貯性和梨果的等級均顯著提高。
3、減輕病蟲藥害
張偉衛等人在2013年的試驗結果表明微生物肥料對大田棉花枯萎病和茄子黃萎病均具有穩定的控制作用，病情指數分別降至38.2 和23.5。煙草專用微生物肥料能減輕煙草病毒病害、促進煙草的生長，降低雜氣和刺激性。微生物肥料能有效減輕土壤中殘留除草劑對作物的藥害。
4、改善土壤結構
長期施用微生物肥料，能夠恢復土壤團粒結構的形成，起到疏松土壤、土壤板結、改善土壤結構的作用。
據報道，在北方寒地黑土上連續3年施用土壤磷素活化劑，土壤容重下降0.1~0.3，疏松土壤效果非常顯著。也有研究表明施入微生物菌肥后，由于微生物大量繁殖，促進了土壤中有機質的釋放，改善了土壤的理化性質，增加了土壤團粒，改善了土壤結構。
微生物肥料存在的問題
1、配套體系不夠完善
目前，我國還沒有形成有利于微生物肥料應用的農業施肥、推廣和監管體系。在發達 大豆接種根瘤菌已成為常規耕作措施，而我國東北大豆根瘤菌的接種率卻不到10%。玉米、水稻等大田作物化肥施用量過度，微生物肥料、有機肥料施用很少，短期行為普遍，推廣力度和政策支持明顯不足。同時微生物肥料市場魚目混雜， 在該類肥料的質量監管上還沒有形成完善的規章制度和產品標準。
2、菌種純度不高、針對性不強
微生物肥料具有生態適應性，施用時應依據當地生態狀況、作物品種、土壤類型和耕作方式等確定具體施用方式和施用量，有針對性地篩選出高適應的功能菌種，以達到較佳的作用效果。但是絕大多數微生物肥料企業還在使用分離篩選及傳統育種等相對滯后的菌種選育技術，造成微生物肥料地域針對性不強，適應性較差，個別企業甚至提純復壯做的都很不到位，導致菌種純度下降、活性衰減、田間效果不穩定或迅速下降。
3、作用效果不穩定
微生物肥料的應用效果受很多因素影響，除肥料本身的活性菌種類、含量、純度等內在因素外，環境條件也是影響肥料效果的重要因素，如底物濃度、溫度、濕度、土壤pH 值等，導致很多微生物肥料的使用效果與預期相差很多，并且地塊間，年度間的差別很大。
高溫悶棚已經推廣多年，其主要目的是殺滅土壤中的有害菌及有害蟲卵，雖然每年夏季幾乎大部分棚室都進行了高溫悶棚，但仍有很多菜農反映，悶棚效果并不如意死棵、線蟲依然發生嚴重。
專家認為這主要是菜農在悶棚操作上，忽視了四個問題：
一是微生物菌的補充時間
菜農朋友都知道，高溫悶棚需要補充額外補充微生物菌肥，通常補充時間是在悶棚后進行。其實，這是不合理的，微生物菌肥 在悶棚前與有機肥，甲殼素、中微量元素肥料一同施入土壤。說到這，菜農朋友肯定會問，微生物菌肥在悶棚前施入，經過高溫悶棚后不都殺死了嗎？還能有效果嗎？
二是重視補充甲殼素
悶棚前補充高分子甲殼素對生物菌的繁殖能起到很大的促進作用。據了解，施入高分子甲殼素后，在25℃地溫下，放線菌數量提高了近30倍，大家都知道，放線菌能夠抑制線蟲的生長，而高分子甲殼素在土壤中分解后能促進放線菌的增殖，因此，悶棚前施用高分子甲殼素可達到減少土壤線蟲的目的。
三是深翻土壤
悶棚前先將所需肥料施入土壤，然后使用大型齒輪的旋耕機旋地深翻，特別是對于老棚來說，這樣的旋耕機旋耕片大，較常規旋耕機翻地深，可以打破犁底層，增加耕作層厚度，促進根系深扎，提高蔬菜抗逆性。對于淺根系的辣椒來說，深翻25厘米即可，其他茄果類蔬菜如茄子、西紅柿需要深翻35-40厘米，這樣可保證根系深扎并有足夠的根量，利于蔬菜的緩苗和健壯生長。
四是悶棚后大水漫灌
高溫悶棚要干悶與濕悶結合，提高悶棚效果。當干悶結束后，選擇晴天放風，進行大水漫灌，然后關閉風口，進行濕悶24小時，目的是土壤濕潤后先讓有害菌及蟲、卵有個“動”的過程，即剛剛萌發或轉化，此時再悶，殺滅效果會更好、更徹底。
給農作物施肥料就像人要合理飲食一樣，都要有一個科學的規律，下面給大家介紹三種。
1、養分補償學說：養分補償學說是養分歸還學說的發展，是施肥的基本原理之一。德國化學家李比希1843年在所著的《化學在農業和生理學上的應用》一書中，系統地闡述了植物、土壤和肥料中營養物質變化及其相互關系，提出了養分歸還學說，認為人類在土地上種植作物，并把產物拿走，作物從土壤中吸收礦質元素，就必然會使地力逐漸下降，從而土壤中所含養分將會越來越少，如果不把植物帶走的營養元素歸還給土壤，土壤終會由于土壤肥力衰減而成為不毛之地。因此要恢復和保持地力，就必須將從土壤中拿走的營養物質還給土壤，必須處理好用地與養地的矛盾，提高自覺投肥的意識。
2、同等重要律：不論大量元素或微量元素，對農作物來說都是同等重要的，缺一不可，缺少了其中的任何一種營養元素，作物就會出現缺素癥狀，而不能正常的生長發育、結實、甚至會死亡，導致減產或絕收。例如作物對銅的需要量很少，但小麥缺少了它就會出現不孕小穗。
3、不可代替律：作物需要的各種營養元素，在作物體內都有其一定的功能，相互之間不能互相代替。如缺少鉀，不能用磷代替，缺磷不能用氮代替，也不能用和它們化學性質十分相似的元素所代替。缺少什么元素，就必須施用含有該元素肥料。
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