復合碳源過促進聚磷菌和反硝化聚磷菌在厭氧、好氧交替狀態下迅速生長, 使其好氧吸磷量大大超過厭氧釋磷量, 即增強微生物對磷的內吸收, 并在好氧末端通過對富磷污泥的排放, 達到除磷的效果。 反硝化菌是屬于異養型兼性厭氧菌, 在缺氧的條件下以 NOx-N 電子受體, 以有機物為電子供體, 反硝化菌利用碳源將亞硝酸鹽氨, 硝酸鹽氮還原成氣態氨(N2). 復合碳源作為有機物為電子供本, 可有效的給反硝化菌提供能量, 加強反硝化反應進行脫氮。

復合碳生物脫氮需要完成硝化和反硝化兩個過程。廢水中的氨氮首先必須被硝化或轉化成亞硝酸鹽和硝酸鹽，然后在反硝化過程中，硝酸鹽被作為細胞呼吸過程中氧化簡單碳化合物的供養體被還原成氮氣。因此，以去除硝酸鹽為目標的反硝化過程必須要有易生物降解的碳源存在。其來源包括進水中溶解性BOD、內源反硝化過程中細胞的糜爛物和各類上清液回流等。當進水溶解性有機物不足而脫氮要求很高時，則需要通過補充化學物質以提供反硝化過程所需要的碳源。該復合碳源藥劑，為黑褐色液體，PH(1％水溶液)3.0-5.0，適用于城市污水以及工業廢水，補充污水中碳源，調節微生物菌種脫氮所需營養比例。

碳源在當下的工業生產當中應用非常廣泛。糖類是較好的碳源,尤其是單糖(葡萄糖,果糖),雙糖(蔗糖,麥芽糖,乳糖),絕大多數微生物都能利用.此外,簡單的有機酸,氨基酸,醇,醛,酚等含碳化合物也能被許多微生物利用。 所以我們在制作培養基時常加入葡萄糖,蔗糖作為碳源.淀粉,果膠,纖維素等,這些有機物質在細胞內分解代謝提供小分子碳架外,還產生能量供合成代謝需要的能量,所以部分碳源物質既是碳源物質,同時又是能源物質。 在微生物發酵工業中,常根據不同微生物的需要,利用各種農副產品如玉米粉,米糠,麥麩,馬鈴薯,甘薯以及各種野生植物的淀粉,作為微生物生產廉價的碳源.這類碳源往往包含了幾種營養要素。