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高溫悶棚已經推廣多年，其主要目的是殺滅土壤中的有害菌及有害蟲卵，雖然每年夏季幾乎大部分棚室都進行了高溫悶棚，但仍有很多菜農反映，悶棚效果并不如意死棵、線蟲依然發生嚴重。
專家認為這主要是菜農在悶棚操作上，忽視了四個問題：
一是微生物菌的補充時間
菜農朋友都知道，高溫悶棚需要補充額外補充微生物菌肥，通常補充時間是在悶棚后進行。其實，這是不合理的，微生物菌肥 在悶棚前與有機肥，甲殼素、中微量元素肥料一同施入土壤。說到這，菜農朋友肯定會問，微生物菌肥在悶棚前施入，經過高溫悶棚后不都殺死了嗎？還能有效果嗎？
二是重視補充甲殼素
悶棚前補充高分子甲殼素對生物菌的繁殖能起到很大的促進作用。據了解，施入高分子甲殼素后，在25℃地溫下，放線菌數量提高了近30倍，大家都知道，放線菌能夠抑制線蟲的生長，而高分子甲殼素在土壤中分解后能促進放線菌的增殖，因此，悶棚前施用高分子甲殼素可達到減少土壤線蟲的目的。
三是深翻土壤
悶棚前先將所需肥料施入土壤，然后使用大型齒輪的旋耕機旋地深翻，特別是對于老棚來說，這樣的旋耕機旋耕片大，較常規旋耕機翻地深，可以打破犁底層，增加耕作層厚度，促進根系深扎，提高蔬菜抗逆性。對于淺根系的辣椒來說，深翻25厘米即可，其他茄果類蔬菜如茄子、西紅柿需要深翻35-40厘米，這樣可保證根系深扎并有足夠的根量，利于蔬菜的緩苗和健壯生長。
四是悶棚后大水漫灌
高溫悶棚要干悶與濕悶結合，提高悶棚效果。當干悶結束后，選擇晴天放風，進行大水漫灌，然后關閉風口，進行濕悶24小時，目的是土壤濕潤后先讓有害菌及蟲、卵有個“動”的過程，即剛剛萌發或轉化，此時再悶，殺滅效果會更好、更徹底。
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農業部批準登記的微生物肥料只有這11類
微生物被擬為土壤養分循環的“轉化器”、環境污染物的“凈化器”、陸地生態系統穩定的“調節器”。可以說，沒有土壤微生物，土壤就失去了活性，就沒有了生產能力。
然而，我國農業長期過度地依賴化肥，導致土壤中大量的有益微生物菌群遭到破壞，土壤活性下降，直觀的表現就是蚯蚓的缺失。因此，要改善當前土壤生態質量，提高土壤生物肥力，當務之急就是補充土壤有益微生物，施用微生物肥料是直接的有效方法。
微生物肥料是由一種或數種有益微生物、經工業化培養發酵而成的生物性肥料，應用于農用生產，通過其中所含微生物的生命活動，增加植物養分的供應量或促進植物生長，提高產量，改善農產品品質及農業生態環境。特別是保護地蔬菜生產中，針對連年超量施肥，土壤中殘余大量未被吸收成分，對土質造成破壞引起的土壤鹽化、酸化，通過施用生物菌肥，可明顯起到改良土壤、減少化肥用量、提高蔬菜品質的作用。
微生物肥料種類
農業部批準登記的微生物肥料產品共有9個菌劑類品種和2個菌肥類品種。
九個菌劑
根瘤菌劑、固氮菌劑、溶磷菌劑、硅酸鹽菌劑、菌根菌劑、光合菌劑、有機物料腐熟劑、復合菌劑和土壤修復菌劑。
微生物菌劑具有直接或間接改良土壤、恢復地力、維持根際微生物區系平衡、降解有毒有害物質等作用。
兩個菌肥
復合微生物肥料是把無機營養元素、有機質、微生物菌有機結合于一體，體現無機化學肥料、有機肥料以及微生物肥料的綜合效果，是化解土壤板結現象，修復和調理土壤，提高化學肥料利用率，提高果實品質及產量的首推肥料。
生物有機肥是指特定功能微生物與主要以動植物殘體為來源并經無害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。
微生物肥料咋施用
微生物肥料具有生態適應性，施用時應依據當地生態狀況、作物品種、土壤類型和耕作方式等確定具體施用方式和施用量，以達到較佳的作用效果。
微生物肥料可用作基肥、追肥、溝施或穴施，還可拌種、浸種、蘸根。生物有機肥一般作基肥、種肥、追肥。農用微生物菌劑除作基肥、種肥、追肥外，還可葉面噴施等。
農用微生物菌劑
主要用作基肥、追肥、育苗肥。固態菌劑一般用量2公斤/畝左右，與40-60公斤有機肥混合均勻后使用。在作物育苗時，可將固態菌劑摻入營養土中拌土，混均后裝入營養缽中育苗；亦可將菌劑稀釋10-20倍液拌種、蘸根、噴根；按1比100比例稀釋后用于灌根、沖施；稀釋500倍液進行葉面噴施。
復合微生物肥
用作基肥10-20公斤/畝，同有機肥或農家肥一起施入；作追肥10-20公斤/畝，作物生長期追施；葉面噴施，稀釋500倍葉面噴施。
生物有機肥
作基肥100公斤/畝，同農家肥一起施入；作追肥比化肥提前7-10天左右，可參照化肥追肥用量施入。
微生物肥料使用注意事項
微生物肥料是生物活性肥料，施用方法比化肥、有機肥嚴格，要注意使用條件，嚴格按照說明書操作，否則難以獲得良好效果。
1、微生物肥料對土壤條件要求比較嚴格。一般菌肥中的生物菌在土壤18℃-25℃時生命活動為活躍，15℃以下時生命活動開始降低，10℃以下時活動能力已很微弱，甚至處于休眠狀態。因此，微生物肥料使用需注意土壤溫度，調節好土壤濕度。
2、注意施肥時期。微生物肥施入土壤后，生物菌需要一個適應、生長、供養、繁殖的過程，一般在15天后可發揮作用。如果作追施，在作物的營養臨界期前施用。施用時間適宜在清晨和傍晚或無雨陰天，這樣可避免陽光中的紫外線將微生物殺死。避免在高溫、干旱條件下使用。
3、微生物肥料不能長期泡在水中，在水田施用應干濕灌溉，促進生物菌活動。以好氣性微生物為主的產品，則盡量不要用在水田。
4、微生物菌劑在施足有機肥基礎上效果佳。如果土壤中的有機質供應充足，生物菌就會大量繁殖，抑制有害菌。反之，生物菌就會因食物缺乏而死亡。因此，作物定植前一定要施足有機肥。
5、微生物肥料可單獨使用，也可與其它肥料混合使用。但微生物肥料應避免與未腐熟的農家肥混用，否則，會因農家肥發酵產生的高溫殺死微生物而影響肥效。此外，避免與過酸、過堿的肥料混用。
6、避免與農藥同時使用。化學農藥都會不同程度抑制微生物的生長和繁殖，甚至殺死微生物。不要將菌肥與殺菌劑、殺蟲劑、除草劑和含硫的化肥（如硫酸鉀等）以及草木灰混合用。不用拌過殺蟲劑、殺菌劑的工具裝微生物肥料。
7、微生物肥料不宜久放，拆包后要及時施用，注意產品保質期。
鹽漬化造成的缺鎂
幾乎所有果園都或多或少存在一定的缺素問題，有些可以通過追施肥料快速緩解，但是，也有很多果園，明明使用了大量肥料，卻還是有缺素癥狀出現，甚至更嚴重。其實，表觀的缺素并不代表土壤中所含的養分低，長期大量使用化肥的背景土壤中，鹽基離子幾乎飽和甚至析出，各種離子之間存在一定的拮抗作用，互為影響有效性，這就是土壤的鹽漬化。
土壤鹽漬造成的缺硼
種植者對鹽漬化認知不足，忽略了對鹽漬化的控制和土壤改良，甚至把鹽漬化危害癥狀在葡萄上的表現判斷為單純缺素癥，不知疏導和控制，而是一味地補充，結果是越補越缺。更有甚者，用一種肥料去調節另一種肥料造成的傷害，結果是傷口撒鹽、雪上加霜，共同傷害。
土壤鹽漬化造成的缺鋅
土壤鹽漬化在土壤上外在表現形式，是綠色青苔、紅苔和白化。這中間有個發展過程。青苔植物作為土壤酸堿指示物早已為廣大種植者所熟知，特別是像生長著白發蘚、大金發蘚的土壤是酸性的土壤；生長著墻蘚的土壤是堿性土壤。隨著鹽漬化程度的加重，鹽漬化土壤表層顏色也有輕微的綠色變成墨綠色，再由墨綠色轉化成紅色，紅色到白色，表層土壤結痂，翹起，毫無生機。
鹽漬化造成的根癌
土壤鹽漬化使葡萄根系對營養和水分吸收受到抑制，使樹勢衰弱，生長受到抑制，抗性嚴重下降，使病害頻繁發生。
鹽漬化造成的根系死亡
對于鹽漬化土壤的危害治理，首先種植者本身要從思想上充分重視起來，加深認識。土壤的承載力有限，有時候投入跟產出不一定成正比，甚至造成嚴重的危害。土壤鹽漬化是個積累的過程，不是一朝一夕的事，有時候，惡果都是人的錯，不一定都是產品的錯，好的產品還要好的使用方法。
對于已經形成鹽漬化的土壤，從技術上來講，要經歷幾個步驟：一清、二耕、三調、四養。
一清
土壤中的無機鹽離子等有害物質，使之與土壤分離，降低土壤溶液的濃度，減輕無機鹽離子對土壤中根系的危害。這是個治標的過程，也是亟待解決的問題，有害物質殘舊在土壤，其他措施發揮效用的效果會大打折扣。
在具體操作上，用大水漫灌的方法溶解析出鹽分，再將水分排出地塊以外，這個過程是個反復的過程，不是一蹴而就的，在保證植株不受害的前提下，可以反復多次，如果土壤表層鹽漬化較重，可以先，再澆水。這個措施同時存在著很大的弊端，比如增加土壤和空氣濕度，使病蟲害發生幾率大大增加，反復澆水也造成了根系危害，但是凡事權衡利弊，有得有失，大水過后注意及時防治病蟲，噴施保護劑。也可在種植設計之初，采取高壟種植，安裝噴淋系統，對于葡萄來說，只要能基本保證根系深度40-60厘米，寬度80-100厘米范圍以內含鹽量不超標，就能正常生長。
二耕
土壤鹽漬造成的葉片畸形黃化
耕作能使土壤鹽漬化受到抑制。深耕深翻能改善土壤理化性質，使土壤通風透氣，加強土壤與外界的熱量和空氣交換能力，活化土壤利于根系的發生發展。翻耕可把表層土壤中的毛細管切斷，土壤毛細管阻斷能減弱土壤水分蒸發，有效地控制土壤表面鹽漬化。
三調
在治理土壤鹽漬化的方法上，根據酸堿中和的原理是種植者普遍認知的治理辦法，且不說土壤的體量那么大，即使是真有哪個行得通的辦法，對土壤也未必是個好事，況且還有人工和物資成本。所以，增施有機肥是行之有效的辦法，這是個治本的過程，能夠達到顯著的長期效應。在增施有機肥的基礎上，合理施用化肥，適量增施菌肥。因為菌肥能使有機肥及早達到功效的，有機肥經微生物細菌分解、轉化形成腐殖質，能提高土壤的緩沖能力，并可和碳酸鈉作用形成腐殖酸鈉，降低土壤堿性。腐殖質還可以促進團粒結構形成，從而使孔度增加，透水性增強，有利于鹽分淋洗，抑制鹽漬化發展。有機質在分解過程中（比如青貯秸稈）產生大量有機酸，一方面可以中和土壤堿性，另一方面可加速養分分解，提高土壤肥力。
四養
以上的增施有機肥、菌肥實質上也是個養土養根的過程，但是除此之外，還有一些農事操作對于土壤鹽漬化的改良也有很大的幫助。
1、地面種植豆科類牧草和作物，耐鹽漬化土壤；
2、種植黑麥草能緩解土壤鹽分上升；
3、地面覆蓋秸稈能緩解水分蒸發；
4、蚯蚓立體養殖，增加土壤養分含量，改變土壤透氣性。
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